strats-smpr/sources/smpr-1re-partie.md

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title: Revue de littérature et référencement
subtitle: Démarrage rapide
creation_date: 2025-01-16T10:03:12+0100
id: 20250116100312
date: Printemps 2026
author:
- Igor Milhit
lang: fr
toc-title: Table des matières
tags: [tags]
---

## Objectifs du document

Ce document a pour objectif de **préparer la session prochaine**, en :

- Rappelant les bases de :
  - La revue de littérature.
  - La citation et de la bibliographie.
- Listant les recommandations de la *Revue médicale suisse* pour les auteurs et
  autrices.
- Expliquant l'intérêt de Zotero.
- Rappelant les principales bases de données pour la recherche de littérature.
- Listant les liens utiles.
- Indiquant comment accéder aux services de la bibliothèque.

Il n'est pas long à parcourir et sert de référence.

Le cours en présentiel portera sur la méthodologie de recherche, avec une démo
Pubmed et une brève démo de Zotero.

:::{#licence}
![Logo de la licence CC BY-SA 4.0][1] \
[CC BY-SA 4.0][2] --- [Sources][3]
:::

## Liens utiles {#first-section}

- **PubMed** avec le *resolver* de l'UNIGE : [unige.ch/biblio/pubmed][5].
- **OpenAthens** pour accéder aux articles depuis les HUG ou
  depuis chez vous : \
  <https://www.unige.ch/biblio/fr/infos/sites/cmu/information-membres-hug/acces>.
- **Commande d'article** qui ne font pas partie de nos collections (gratuit) :
  \
  <https://www.unige.ch/biblio/fr/infos/sites/cmu/information-membres-hug/commande-article>.
- **Service d'aide à la recherche**. Riche documentation sur la recherche de
  littérature. Soutien à la recherche, sur rendez-vous (formulaire à remplir) :
  \
  <https://www.unige.ch/biblio/fr/infos/sites/cmu/recherche-documentaire/>.
- **Inscription à la bibliothèque**. Gratuit et nécessaire pour la commande
  d'article : <https://registration.slsp.ch/?iz=unige>.
- **Création du compte Switch edu-ID**. Gratuit et nécessaire pour
  l'inscription à la bibliothèque : <https://eduid.ch/web/registration/1/>.
- **Guide Vancouver** de la bibliothèque :
  <https://www.unige.ch/biblio/index.php/download_file/22303/>.
- **Guide pour référencer l'usage « d'IA »** :
  <https://unige.ch/-/biblio/referencer-iag>.

## Services de la bibliothèque

Sur la page d'accueil de la Bibliothèque, site CMU, se trouvent deux blocs
contenant :

1. Des ressources accessibles *en 1 clic*.
1. Une liste de *services*.

Pour y accéder, le chemin depuis la page d'accueil de l'UNIGE est :

```txt
unige.ch / services / bibliothèque / site UNI CMU
```

Puis, *scroller* jusqu'à trouver les deux blocs de la capture ci-dessous.

L'autre solution est de chercher *via* un moteur de recherche `unige
bibliothèque cmu`.

![Ressources et services de la bibliothèque][4]

1. Lien vers PubMed un bouton qui
   permet de rebondir sur le catalogue de la bibliothèque lorsque l'accès au
   *full text* n'est pas possible. (Voir la section [PubMed][12]) \
   Le lien suivant fonctionne aussi : [unige.ch/biblio/pubmed][5].
1. Lien vers Embase. Sur abonnement, nécessite soit OpenAthens, soit d'être
   sur le réseau de l'UNIGE (ou encore d'utiliser un compte Elsevier).
1. Informations utiles pour accéder aux ressources de la bibliothèque depuis
   les HUG.
1. Service d'aide à la recherche. Page proposant beaucoup de documentation,
   mais aussi un formulaire pour obtenir un rendez-vous pour vous accompagner
   lors de votre recherche. Le service est très demandé, prévoyez un délai.

## Revue de littérature

De façon générale, une *revue de littérature* est indispensable pour avoir une
vision d'ensemble de l'état des connaissances actuelles sur un sujet précis,
comme une question clinique.

Elle permet également de situer votre travail dans la continuité des recherches
précédentes. Enfin, dans votre contexte, elle constitue le matériel pour la
mise à jour d'une stratégie, et pour la rédaction de l'article qui
l'accompagne.

Dans le contexte des *stratégies de médecine de premier recours*, la revue de
littérature est la base sur laquelle s'appuient leurs mises à jour.

## Citation et bibliographie

La bibliographie de vos publications indique à la fois *l'étendue de vos
recherches* et *la qualité de votre papier*. Mais celle-ci vous permet de
créditer les chercheurs et les chercheuses qui vous précèdent.

Plus directement, les citations et la bibliographie est la méthode essentielle
pour éviter le plagiat, ce qui est un des éléments fondamentaux de la démarche
scientifique. De la même manière, c'est ce qui permet au public de vos travaux
de retrouver vos sources. Par sources, il faut comprendre les documents que
vous avez lus *et* cités.

La façon dont vous insérez des citations, avec leur « appel à citation » et
dont vous rédigez les références dans la bibliographie, dépend du *style de
citation*. Il est en général imposé par les éditeurs.

## Recommandations de la Rev Med Suisse

La *Revue médicale suisse* regroupe des recommandations aux auteurs et autrices
sur la page [« Publier dans la revue »][6] (dans l'entrée de menu « Revue
médicale suisse »). Les points 17 et 18 concernent les citations et la
bibliographie :

- Les appels à citation se font selon un style *numérique*, à l'aide d'un
  chiffre arabe en exposant, par ordre d'apparition.
- Les références dans la bibliographie doit suivre le style
  [*NLM/Vancouver*][7].
- Tous les auteurs et autrices doivent être indiquées, mais au maximum 3, en
  ajoutant *et al.* après une virgule.
- Au maximum 15 références, sauf pour une revue de littérature.
- Si possible 1 ou 2 références en français.

Pour le style Vancouver, vous pouvez consulter :

- Le [guide de la bibliothèque][8], en français, au format PDF.
- La [norme complète][7] en anglais, sur le site de la NLM (si vous êtes
  curieux/se).

Mais le mieux est d'utiliser le gestionnaire de références bibliographiques
Zotero.

::: {.warning}

La *Revue médicale suisse* a une [charte][15] concernant « l'IA » qui précise
les usages admis. La transparence quant à l'utilisation de ces outils est
exigée. \
La bibliothèque de l'UNIGE met à disposition un [guide][16] pour vous aider.

:::

## Gestionnaires de références bibliographiques

Un *gestionnaire de références bibliographiques* est un logiciel qui facilite
l'insertion des citations et la rédaction de la bibliographie. Zotero est l'un
de ces logiciels, à préférer :

- Il est gratuit[^1].
- Sa licence est « libre » (GPL v3).
- Il est installable dans le contexte informatique des HUG.
- Il dispose d'une très large communauté qui met à disposition des extensions
  mais aussi de l'aide.

Le principe est le suivant :

1. Récolte des références (livres, articles scientifiques, etc.), le plus
   souvent sur le web, mais aussi manuellement si nécessaire.
2. Organisation des références dans Zotero, au moyen de collections et
   d'étiquettes (marqueurs).
3. Synchronisation des références avec le site Zotero et d'autres appareils,
   ainsi que partage de bibliothèques de références avec d'autres personnes
   pour un travail collaboratif.
4. Annotation des *full texts*.
5. Insertion des citations au moment de la rédaction, avec une gestion
   automatique des appels de citation.
6. Génération automatique de la bibliographie, selon un style sélectionné.

Sur le court terme, Zotero facilite la rédaction d'un travail. Sur le long
terme, il peut devenir une partie de votre mémoire documentaire.

::: {.warning}

Zotero apporte des gains de temps substantiels, **à la condition** de le prendre
en main **dès maintenant**. Des formations sont proposées par la
bibliothèque : \
<https://www.unige.ch/biblio/fr/formation/rendez-vous-info-scientifique/zotero>.

:::

Pour démarrer, vous avez besoin :

1. D'installer, depuis la page [zotero.org/download][9] :
    1. Le logiciel Zotero.
    1. Un connecteur pour votre navigateur web (Firefox, Safari, etc.).
1. De vous créer un compte sur [zotero.org][10], pour :
    1. Synchroniser votre bibliothèque de références avec le serveur de Zotero
       et vos autres appareils.
    1. Travailler à plusieurs sur une bibliothèque de groupe.

Un [guide rapide][11] existe sur le site de la documentation en français du
logiciel.

## Bases de données documentaires

### PubMed

PubMed est une base de données, accessible librement, de littérature
biomédicale publiée dans des revues avec relecture par les pairs
(*peer-review*). Elle contient, en janvier 2026, plus de 39 millions d'entrées.
Chaque entrée est une référence ainsi que l'*abstract* lorsqu'il existe.

*Medline* est la plus grande partie de PubMed et est constituée d'articles
*indexés* à l'aide « de mots clés », les termes MeSH. Les articles qui ne sont
pas (encore) indexés ne peuvent pas être trouvés seulement en utilisant les
termes MeSH (dont l'usage est expliqué lors de la démo de PubMed), mais impose
l'ajout de termes de recherche en langage naturel. \
*PubMed Central* (PMC) est la partie de PubMed dont les *full texts* des
articles sont librement accessibles.

Il existe une URL pour une version de PubMed avec un bouton de
l'UNIGE (un *resolver*), qui permet de chercher une référence dans le catalogue
de la bibliothèque. C'est utile lorsque vous ne parvenez pas à obtenir le *full
text* de la référence. Le catalogue vous indique où vous pouvez l'obtenir si
vous y avez droit, ou de le demander à la bibliothèque s'il ne fait pas partie
de nos collections (Voir la [commande d'article][13], service gratuit).

L'URL à utiliser est :

- Soit le raccourci : [unige.ch/biblio/pubmed][5].
- Soit le lien complet (que vous pouvez mettre en *bookmark*) : \
  <https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?otool=ichbfmglib>.

![Résolver UNIGE dans PubMed][14]

La création de compte donne la possibilité d'enregistrer ses recherches et de
configurer des alertes. Les alertes sont très utiles pour être automatiquement
averti-e des nouvelles publications correspondant à votre recherche, pour ne
pas louper des articles importants, publiés après vos recherches de
littérature, mais avant la finalisation de votre propre papier.

Des formations sont données par la bibliothèque sur PubMed : \
<https://www.unige.ch/biblio/fr/formation/rendez-vous-info-scientifique/pubmed/>.

### Embase

Embase (<https://embase.com>) est en partie équivalente à PubMed, mais est
proposée par Elsevier sous licence. Vous y accédez soit en étant dans le réseau
de l'UNIGE, soit au moyen d'OpenAthens.

Elle contient Medline, ainsi que plus de 3300 revues scientifiques
exclusivement couvertes par Embase. Parmi celles-ci se trouve bon nombre des
revues européennes, ce qui fait qu'Embase est meilleure pour rechercher des
publications qui ne sont pas en anglais.

L'équivalent des termes MeSH dans Embase se nomme *Emtree*.

La création de compte donne la possibilité d'enregistrer ses recherches et de
configurer des alertes.

Des formations sont données par la bibliothèque sur Embase : \
<https://www.unige.ch/biblio/index.php?cID=1572>.

### Google Scholar

Google Scholar (<https://scholar.google.com>) est un moteur de recherche utile
pour trouver de la littérature scientifique. Il n'offre pas les mêmes
fonctionnalités de recherche avancée que Pubmed ou Embase, mais il permet
de trouver de la *littérature grise*, à savoir des rapports ou des bonnes
pratiques publiées par des hôpitaux ou des organisations internationales.

C'est un outil multidisciplinaire, aussi il peut être nécessaire de préciser
avec un concept supplémentaire que votre recherche concerne le domaine de la
santé.

Google Scholar offre depuis 2025 une interface permettant l'interrogation en
langage naturel : <https://scholar.google.com/scholar_labs/>. Il nécessite un
compte Google.

### Consensus

Consensus (<https://consensus.app>) est un outil de recherche basé sur
« l'intelligence artificielle », ou plus précisément sur des *modèles de
langage*. Comme le Google Scholar Labs, il permet des requêtes en langage
naturel. Ses recherches se font sur un corpus de publications scientifiques
(Semantic Scholar et des accords avec certains éditeurs).

En 2026, la Bibliothèque de l'UNIGE propose en test un accès à la version
« pro » de Consensus. Pour cela, il suffit de s'identifier avec une adresse
e-mail de l'UNIGE ou des HUG.

Ce genre d'outil est plus adapté à l'exploration d'un sujet qui n'est pas
encore maîtrisé et ne remplace pas une méthode rigoureuse de recherche dans
Pubmed, essentiellement pour deux raisons :

1. Le processus de sélection n'est ni transparent, ni reproductible.
1. La nature probabiliste du fonctionnement des modèles de langage ne permet
   pas d'exclure la génération de texte erroné.

Ces critiques sont valables, à des degrés divers, pour tous les outils
utilisant des modèles de langage, y compris Google Scholar Labs.

<!-- références -->

[^1]: La version gratuite du compte Zotero met à disposition 300 Mo d'espace
disque sur ses serveurs. Ce n'est une limite que si on associe systématiquement
les *full texts* en PDF. De plus, pour augmenter l'espace disque à 2 Go (ce qui
est très confortable), le coût annuel n'est que de 20 USD. L'organisme qui
développe Zotero est à but non-lucratif.

[1]: ./static/images/by-sa.svg
[2]: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/deed.fr "Texte de la licence en français"
[3]: https://git.milhit.ch/igor/strats-smpr
[4]: ./static/images/services-en-1-clic.png
[5]: https://unige.ch/biblio/pubmed
[6]: https://www.revmed.ch/publier-dans-la-revue
[7]: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK7256/
[8]: https://www.unige.ch/biblio/files/3017/2537/0370/Guide_Citation_Vancouver.pdf
[9]: https://zotero.org/download
[10]: https://zotero.org
[11]: https://docs.zotero-fr.org/quick_start_guide/
[12]: #pubmed
[13]: https://www.unige.ch/biblio/fr/infos/sites/cmu/information-membres-hug/commande-article
[14]: ./static/images/resolver-context.png
[15]: https://www.unige.ch/biblio/index.php/download_file/22303/
[16]: https://unige.ch/-/biblio/referencer-iag